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A Pathology Foundation Model for Cancer Diagnosis and Prognosis Prediction

data: 19 个解剖部位预训练数据;32 个独立测试集,覆盖 24 家医院/队列

Nature 2024 · 论文 · 作者代码

引言

结合 tile 级无监督预训练和切片级弱监督预训练,学习跨任务病理表征,覆盖癌细胞检测、肿瘤来源、分子特征与预后预测。

方法

(1)Tile 预训练:无监督编码细胞形态和局部组织特征。

(2)切片预训练:以弱监督学习器官与整体组织模式。

(3)跨任务迁移:用共享病理表征适配检测、来源、分子和预后任务。

CHIEF:方法相关图示

原文Fig. 1,PDF 第 30 页。

实验

实验设置

预训练使用 60,530 张 WSI,外部验证使用 19,491 张;覆盖癌检测、来源、分子及预后任务。

主要结果

预后评估中作者报告平均 C-index 为 0.74,比较 PORPOISE 的 0.62 和 DSMIL 的 0.67;该数字属于对应评估集。

消融与讨论

同时阅读跨癌种外部验证与生存分层,不把预训练规模和下游样本规模相加。

参考文献

A Pathology Foundation Model for Cancer Diagnosis and Prognosis Prediction

Nature 2024 · 论文 · 作者代码