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WiKG

Dynamic Graph Representation with Knowledge-aware Attention for Histopathology Whole Slide Image Analysis

data: TCGA-ESCA、TCGA-KIDNEY、TCGA-LUNG;内部 FROZEN-LUNG

CVPR 2024 · 论文 · 作者代码

引言

把切片建模为动态知识图,根据实例头尾关系生成邻居和有向边,再通过知识感知注意力聚合节点与边信息。

方法

(1)动态邻居:根据实例特征而非仅物理坐标选择相关节点。

(2)有向边编码:以头尾关系构建边表示,刻画实例间的非对称联系。

(3)知识注意力:联合邻居和边更新节点,再经全局池化输出图级表示。

WiKG:方法相关图示

原文Figure 1,PDF 第 1 页。

实验

实验设置

同时做组织类型与 TNM 分期,TCGA 使用四折评估;另外使用 170 例冷冻切片验证泛化。

主要结果

重点是动态有向图优于仅按空间邻近构图的方案;论文另外报告图结构可视化和计算效率。

消融与讨论

考察边构建、知识感知注意力及邻居数,避免把动态邻居选择和最终池化混为同一机制。

参考文献

Dynamic Graph Representation with Knowledge-aware Attention for Histopathology Whole Slide Image Analysis

CVPR 2024 · 论文 · 作者代码