WiKG
Dynamic Graph Representation with Knowledge-aware Attention for Histopathology Whole Slide Image Analysis
data: TCGA-ESCA、TCGA-KIDNEY、TCGA-LUNG;内部 FROZEN-LUNG
引言
把切片建模为动态知识图,根据实例头尾关系生成邻居和有向边,再通过知识感知注意力聚合节点与边信息。
方法
(1)动态邻居:根据实例特征而非仅物理坐标选择相关节点。
(2)有向边编码:以头尾关系构建边表示,刻画实例间的非对称联系。
(3)知识注意力:联合邻居和边更新节点,再经全局池化输出图级表示。

原文Figure 1,PDF 第 1 页。
实验
实验设置
同时做组织类型与 TNM 分期,TCGA 使用四折评估;另外使用 170 例冷冻切片验证泛化。
主要结果
重点是动态有向图优于仅按空间邻近构图的方案;论文另外报告图结构可视化和计算效率。
消融与讨论
考察边构建、知识感知注意力及邻居数,避免把动态邻居选择和最终池化混为同一机制。
参考文献
Dynamic Graph Representation with Knowledge-aware Attention for Histopathology Whole Slide Image Analysis